在整個(gè)PCR體系中，引物占有十分重要的地位。PCR的特異性要求引物與靶DNA特異結(jié)合，不與其他非目的的DNA結(jié)合，PCR的靈敏性要求DNA聚合酶能與引物進(jìn)行有效的延伸，可見引物設(shè)計(jì)好壞與PCR結(jié)果密切相關(guān)。
一、方法不同
1、普通pcr引物設(shè)計(jì)：引物的優(yōu)劣直接關(guān)系到PCR的特異性與成功與否。
2、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì)：通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針，標(biāo)記跟蹤PCR產(chǎn)物進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)反應(yīng)，利用與之相適應(yīng)的軟件對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析，計(jì)算待測(cè)樣品模板的初始濃度
二、原理不同
1、普通pcr引物設(shè)計(jì)：為了找到一對(duì)合適的核苷酸片段，使其能有效地?cái)U(kuò)增模板DNA序列。
2、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì)：在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)，通過熒光信號(hào)不斷累積而實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR全程，然后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在實(shí)時(shí)熒光定量PCR中，對(duì)全程PCR擴(kuò)增過程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)，根據(jù)反應(yīng)時(shí)間和熒光信號(hào)的變化可以繪制成一條曲線。
三、注意事項(xiàng)不同
1、普通pcr引物設(shè)計(jì)：引物應(yīng)用核酸系列保守區(qū)內(nèi)設(shè)計(jì)并具有特異性。產(chǎn)物不能形成二級(jí)結(jié)構(gòu)。引物長(zhǎng)度在15~30堿基之間。
2、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì)：實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 儀應(yīng)安放在濕度較低、灰塵較少、遠(yuǎn)離水池的平穩(wěn)臺(tái)面上，不能有強(qiáng)光直射，室內(nèi)應(yīng)通風(fēng)良好，無(wú)腐蝕性氣體
可可.jpg)
