ELISA和Western-blot的基本實驗原理是一致的——都是基于抗原-抗體特異性結合免疫結合反應的原理，不同的地方則是在于實驗過程，還有實驗想要的結果數據等等。蛋白質分析和鑒定方法常用的就是ELISA和Western Blot（以下簡稱WB）。主要區(qū)別在于：
? ELISA對于抗原、抗體都能檢測。
? WB則主要檢測抗原。
此外，了解這兩種方法的優(yōu)缺點，即可輕而易舉地解決如何選擇的問題。
一、ELISA:
? 靈敏度高、應用領域廣泛，檢測樣本濃度可低至pg/ml，操作相對簡單，用于確定樣品中是否存在蛋白質的高效方法，亦可精確定量蛋白質的濃度。
? ELISA 具有包被、封閉、檢測、 結果讀取4個常規(guī)操作步驟，有直接、間接、夾心及競爭檢測4種主要類型。
ELISA的優(yōu)缺點：
優(yōu)點：適合體液(血清、尿液等)、細胞上清樣本；靈敏度高，操作簡單、高效、快速（1-2h），需樣品量較少，可以同時進行多個樣本分析。另外，也可靈活地DIY 檢測試劑盒，即可降低成本，又解決了實驗需求；同時ELISA可搭配實驗室高通量或自動化設備，實現自動化操作。
缺點：實驗操作過程中，由于操作問題、樣品污染、使用低質量試劑等原因，其特異性方面經常受到影響，可能會產生假陽性或假陰性結果；此外試劑盒中的抗體組分須低溫運輸、儲存；ELISA無法提供有關目標蛋白的質量和豐度等其他信息。
二、Western Blot：
? Western Blot是一種通過電泳、轉膜、抗體孵育、成像等步驟對目標蛋白進行檢測的方法。
? 操作流程相對復雜，用于識別和了解蛋白質的一些特征元素、蛋白質相互作用和修飾等。
? 可提供目標蛋白的詳細信息，如蛋白質大小和豐度等，也常被用于ELISA和其他檢測方法結果的驗證，它可以有效地幫助排除假陽性或假陰性的結果。
Western Blot的優(yōu)缺點：
優(yōu)點：適用于組織或細胞裂解液樣本；檢測結果簡單易懂；特異性高，能夠從多種蛋白質中識別目標蛋白；可提供目標蛋白的分子量、表達豐度等信息；熒光Western Blot，可以在一個實驗中進行多重檢測，檢測多種蛋白質。
缺點：傳統(tǒng)操作步驟繁瑣、耗時（1到2天），體系如果沒有優(yōu)化，容易出現信號衰減快、高背景等情況，導致不理想的檢測結果；同時檢測靶蛋白的數量受限于一抗和二抗的組合；通常被用作驗證方法。
三、ELISA or Western Blot怎么選？
若實驗目的是需要簡單、快速地確定蛋白質是否存在，并需要得到精確濃度，ELISA是更好的選擇。
若實驗目的是需要得到更多關于蛋白質的信息，比如分子量、純度、蛋白質間相互作用、蛋白質表達變化或翻譯后修飾等，則Western Blot更適合。
此外，Western Blot和ELISA檢測的結果也可相互印證。
