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【預期用途】
本產(chǎn)品就是以染料法熒光定量 PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測的試劑盒。
【檢驗原理】
本試劑盒即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板,引物經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高,分析靈敏度可以達到 100 拷貝/反應,提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品,特異性高,引物是根據(jù)指標高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他生物的 DNA發(fā)生交叉反應,本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的染料法熒光定量 PCR 反應,既可用于定性,也可用于定量。用于定量時線性范圍至少5個數(shù)量級。
【試劑組成】
名 稱
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規(guī) 格
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2×SYBR qPCR MasterMix
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0.5mL×1管
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熒光 PCR 專用模板稀釋液
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1mL×1 管
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超純水
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1mL×1 管
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染料法qPCR 引物混合液
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100μL×1 管
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qPCR 陽性對照(1×10E7 拷貝/μL)
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50μL ×1 管
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說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【運輸及保存】
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月。
【自備試劑】
樣品 DNA。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【使用方法】
- 試劑準備(試劑準備區(qū))
稀釋標準曲線樣品(以 10E1-10E6 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。
由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。
1. 標記 6 個離心管,分別為 6,5,4,3,2,1。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同。
3. 在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 4 號管中加入 5 μL 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E4 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
- 樣本處理(樣本處理區(qū))
2.1如果有 N 個樣品,最好設(shè)置 N+2 個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?10μL 第 6 步所得的第 4 號稀釋液(1×10E4 拷貝/μL)再加上一定量的水使總體積跟核酸純化試劑盒所要求的起始樣本體積一樣,以此作為 PC。另外用水作為 NC。
2.2 核酸提?。汉怂崽崛】梢圆捎蒙虾嵘鷮崢I(yè)有限公司的核酸提取或純化試劑,操作方法按照說明書進行。
3.染料法 qPCR 反應(20μL 體系,在樣品制備室進行)
3.1如果做定量分析并且只做 1 次重復,則標記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),6 個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復,則標記 N+4 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1 個用于 PCR 陽性對照(用第 6 步第 4 號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加):
成分
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樣品管
N+2 個
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PCR 陰性
對照管
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標準曲線
樣品管(1-6 管)
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2×SYBR qPCR
MasterMix
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10μL
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10μL
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各10μL
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染料法qPCR 引物混合液
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2 個待測 DNA 模板
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8μL
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-
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-
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超純水
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-
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8μL
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-
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第 6 步所得標準曲線樣品稀釋液(1-6 號)
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-
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-
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各 8μL(2 號樣到2 號管,3 號樣到
3 號管…)
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蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行 PCR:
過程
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溫度
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時間
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預變性
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95℃
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5 分
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PCR反應
(35個循環(huán))
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95℃
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10 秒
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60℃
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40 秒(采集 SYBR 通道的熒光信號)
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溶解曲線分析
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按 qPCR 儀器手冊執(zhí)行
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注意:循環(huán)次數(shù)不要超過 35 個循環(huán)。
【結(jié)果判定】
- 通過溶解曲線分析的結(jié)果排除無效數(shù)據(jù)。有 Ct 值,但 Tm 值跟陽性對照 Tm不一樣的樣品(包括對照和待測樣品),歸為假陽性,數(shù)據(jù)無效,不予以分析。Tm 跟陽性對照 Tm 一致的,為有效 Ct。
- 如果兩種陰性對照的溶解曲線所得 Tm 值跟陽性對照的 Tm 值一樣,說明環(huán)境或試劑可能有過去的 PCR 擴增產(chǎn)物污染,則此次實驗無效,需要解決污染問題再進行實驗。
- 如果兩種陰性對照(樣品制備陰性對照和 PCR 陰性對照)是假陽性,可以繼續(xù)分析其它樣品有效數(shù)據(jù)。
- 對定量檢測,以陽性對照樣品的濃度的 log 值為橫軸,以有效 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的有效 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 DNA 濃度的 log 值,再換算出待測樣品的 DNA 濃度。
- 對定性檢測,則有有效 Ct 值的為陽性,無有效 Ct 值的為陰性。
【注意事項】
1.PCR 操作各階段應嚴格分區(qū)操作,避免交叉污染。
2.各組分不得與其他產(chǎn)品或不同批號的相應成分進行互換。
3.待測標本若不及時檢測,應保存于-20℃或-70℃。
4.樣品的處理應該嚴格按照生物安全規(guī)范操作。
5.PCR 操作人員應具有經(jīng)驗和受過專業(yè)培訓。
6.本試劑盒僅用于科研使用,不做為臨床診斷使用。
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