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LAMP Loop DP-Probe (訂制品)
A-PJ1021
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公司產(chǎn)品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!

商品屬性:

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LAMP Loop DP-Probe (訂制品) 

800Tx25μl

A-PJ1021

描述:

該 DP-Probe(DisPlaceable Probe)為鏈置換熒光探針,專用于LAMP 的熒光擴(kuò)增。Loop DP-Probe 在搭配 HotStart Bst4.2 Basic 試劑時(shí)表現(xiàn)出極為出色的特異性,可以大幅降低非特異性擴(kuò)增。LoopDP-Probe Pair 是將 Loop 引物進(jìn)行改造(LF/B 任意一條均可),其由兩條標(biāo)記引物退火組成:熒光猝滅引物(5’IBFQ+Tail+Loop)和熒光報(bào)告引物(Tail 互補(bǔ)區(qū)+3’發(fā)光基團(tuán)),其不發(fā)熒光。在 LAMP反應(yīng)中 Loop 引物滲入到“啞鈴”結(jié)構(gòu),由擴(kuò)增返回“啞鈴”延伸并置換游離的熒光報(bào)告引物,累積產(chǎn)生熒光信號(hào)。詳細(xì)的原理可參考文獻(xiàn) PMID: 33626039。有經(jīng)驗(yàn)的研究人員可根據(jù)參考文獻(xiàn)自行制備 LAMP Loop DP-Probe Pair,經(jīng)驗(yàn)不足的人員可委托  來(lái)制備, 提供三種熒光標(biāo)記的探針。需要客戶提供 Loop 序列,并指明需要的熒光標(biāo)記(FAM/JOE/ROX)。

eLAMP DP-Probe 試劑的開發(fā)簡(jiǎn)述
1. 引物的粗篩選
無(wú)論是變色、試紙條、熒光法 eLAMP 試劑的開發(fā),前期的測(cè)試過(guò)程, 推薦采用價(jià)格較低的液體 HotStart Bst4.2 SYBR Green試劑(進(jìn)行粗篩選。通常篩選的引物為 3-5 組。10xeLAMP Mix:FIP/BIP=8 μM each; LF/LB=4 μM each.測(cè)試樣品:10e3、100、25、10Copies/管,NTC(16-32 重復(fù))
2.5xBst4.2 SYBR Green Mix 10 μl
10x ePrimer Mix 2.5 μl
HotStart Bst 4.2(8U/μl) 1 μl
模板 DNA/RNA X μlddH2O 到總體積 25 μl置于 70°C 反應(yīng) 45min,1min 收集一次熒光信號(hào)。

良好的引物組具有 以 下 特 性 (Ct) :

10e3copies =5-10min; 25copies <15min;10Copies<20min, NTC 均>40min. 以上實(shí)驗(yàn)需要反復(fù)確認(rèn),以確
保核心引物的工作效率,否則重新篩選,再進(jìn)行后續(xù)的其它測(cè)試。
2. Loop DP-Probe Pair 的制備
根據(jù)上述引物組的篩選情況,選取最佳引物組。在此基礎(chǔ)上改造LF 或 LB,改造哪一條效果更佳,必須經(jīng)過(guò)測(cè)試。下面以改造 LF為例進(jìn)行說(shuō)明。 通常提供 25x 的 LF DP-Probe Pair(或自行制備)。

注意:

(1)測(cè)試試劑更改為 HotStart Bst4.2 Basic 試劑。

(2)10xeLAMP Mix 引物濃度有調(diào)整。
10xeLAMP Mix:FIP/BIP=8 μM each; LB=4 μM;LF=3 μM.
2.5xBst4.2 Basic Mix 10 μl
10x ePrimer Mix 2.5 μl
25x LF DP-Probe Pair 1 μl
HotStart Bst 4.2(8U/μl) 1 μl
模板 DNA/RNA X μl
ddH2O 到總體積 25 μl
置于 70°C 反應(yīng) 45min,1min 收集一次熒光信號(hào)(注意根據(jù)探針熒光標(biāo)記,選取正確的熒光通道)。與 SYBR Green 結(jié)果相比來(lái)看,時(shí)間會(huì)滯后 1-3min。NTC 的控制會(huì)明顯提升。

此時(shí)可進(jìn)一步做后續(xù)的其它項(xiàng)目測(cè)試。
3. 如有試劑凍干制備的需求可采用如下幾種方案:
(1)(液體試劑)+PrimerMix 自行凍干(專業(yè)人員使用)。
(2)PrimerMix+(引物凍干劑)自行凍干,加入 (凍干球)。
(3)(HotStart Bst4.2),全程自行凍干(專業(yè)人員使用)。
(4)委托  進(jìn)行全體系凍干。

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HotStart Bst 4.2 Basic Mix(可凍干)
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